【色质谱实验室：陈银娟博士撰文】

【仪器设备：液相色谱，单四极杆液质，APC, 反向制备色谱等相关仪器】

【地点：4号楼219室色质谱实验室】

Empower是色质谱实验室使用频率较多的一款数据采集处理软件，相比高分辨质谱使用的Masslynx软件，Empower软件逻辑清晰：数据存储、仪器运行及数据处理三个模块相互独立，并且可以实现批量样品运行、批量数据导出及批量数据处理。基于目前使用，建议用户在使用Empower时，记住一点：基于方法进行操作。具体地说，Empower中样品运行有运行方法，数据处理有处理方法，而数据导出需要有数据导出方法。这里将跟大家分享：基于Empower软件，如何建立数据导出方法并实现数据批量导出。

Step 1.创建数据存储路径：比如在桌面建立”lcms data”文件（图1），后续导出的数据将保存于此文件下

图1

Step 2.打开Empower数据存储文件

比如我们需要导出保存在LC-MS项目下的部分数据，则打开路径为：Browse Projects-training-LC-MS（图2）

图2

Step 3.建立数据导出方法

打开数据文件后，选择File-New Method-Export Method（图3），弹出Export Method Editor (图4)，在（1）Fields列输入Filename（如EXP method-20211114）;在（2）Raw Data列，输入Filename（如PDA_192nm）,勾选File ASCII选项，并选择导出数据保存路径，即Step1中建立的lcms data文件（图5）。

注：Raw Data输入的Filename,是指批量导出的数据文件名称。

图3

图4

图5

Step 4.保存数据导出方法文件

如图6，点击：File-Save;在Name中输入方法名称（exp_method_20211114）-Save保存

图6

Step 5.选择需要导出的数据通道

在进行Step2操作后，即可进行数据查看（图7），我们可以按Sample Sets, Injections, Channels进行数据分类查看，也可以逐一进行筛选。如图7，我们在Injections类别下选择13-22行，右键-View As-Channels，这样就会显示injections中13-22行的检测通道数据（图8）；

在图8中，点击Channel Description，可以将相同检测通道进行归类，图中我们需要导出PDA检测器192 nm的二维数据，则选中此类数据后，右键-Export…

图7

图8

Step 6.数据导出操作

在进行Step 5操作后，在弹出的对话框Exporting框，选择Use specified export method,下来选择Step 4中保存的导出方法文件，点击OK确认（图9）。

图9

Step 7.导出数据查看

进行Step 6操作，软件即完成数据的批量导出并保存于Step 1建立的lcms data文件。图10中，我们可以看到软件成功进行了数据导出，所有文件名都含有PDA_192nm字样（Step 3中方法的定义），之后是数字代号。

注：目前Empower存储的检测通道文件均为数字代号，所以接下来我们需要将数字代号和样品通道进行统一。

图10

Step 8.数字代号与实际通道的统一

回到Step 5导出数据选择界面，右键-Table Properties…,如图11，勾去Channel Id-OK确认，即可看到每个检测通道数据对应的Channel Id (图12)。

图11

图12

用户将图12中的Channel代号与Step 7中的导出数据文件进行统一即可。导出的数据可以用Origin, Excell等软件进行后续处理。需要提醒的是，通常情况文章发表建议用原软件产生的谱图，并且Empower可以实现图谱的进一步美化处理，我们导出的二维数字文件，非常容易篡改，利用第三方软件处理原数据，请大家秉承学术道德原则。