电镜实验室主要以微观结构的表征研究为主，旨在为西湖大学和全社会提供各种材料和器件的微区表征分析，建立材料结构与性能之间的关联，探索提高材料性能的途径。目前，在云谷校区，电镜实验室已配置了四台场发射扫描电镜（日立 Regulus8230；日立 SU8600/Monnac Pro；赛默飞 Thermo QuattroS；蔡司 Gemini450），三台原子力显微镜（牛津仪器 Cypher ES；布鲁克 NanoWizard V；牛津仪器JupiterXR），三台透射电镜（赛默飞 Spectra Ultra；Talos F200X G2；Talos L120C G2），一台聚焦离子束-电子束双束电镜（FIB-SEM）-飞行时间二次离子质谱联用系统(TOF-SIMS)，以及相应的制样设备，实验室将配置高端技术服务团队，提供高水平的电子显微学技术支持。
